Секвенирование генома — это основанный на ядерных технологиях метод, позволяющий определить нуклеотидную последовательность рибонуклеиновой кислоты (РНК) и дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) патогенных микроорганизмов. С помощью этого метода описывается состав генетического материала, что помогает ученым прогнозировать функцию анализируемого генома, его влияние, а также поведение патогена. В результате появляется возможность не только диагностировать заболевание, но и получить информацию о его происхождении, эволюции и исходящей от него потенциальной угрозе.
Такие основанные на ядерных технологиях инструменты и методы часто используются для филогенетического анализа ящура и других заболеваний, таких как бешенство, бруцеллез и болезнь, вызванная вирусом Эбола.